A AMAZONAVES possui em Manaus – AM sua Base de Manutenção, situada no Aeródromo de Flores, Hangar F, hangar este com 54 x 68 m de área total, com instalações, ferramental e equipamentos necessários para uma manutenção dentro dos padrões exigidos pelos fabricantes das aeronaves e pela ANAC. É autorizada pela ANAC a executar IAM, Manutenções de Linha, e troca de todo e qualquer componente em todas as aeronaves de sua frota.

A equipe do Setor de Manutenção é composta por um Engenheiro de Manutenção Aeronáutica, Inspetor de Manutenção e Mecânicos de Manutenção Aeronáutica devidamente habilitados.

O CTM – Controle Técnico de Manutenção possui todas as publicações necessárias e atualizadas para manter as aeronaves dentro dos padrões de aeronavegabilidade e segurança exigidos pelos fabricantes e pela ANAC, efetuando um efetivo e rígido controle das aeronaves e seus componentes controlados.

Para as manutenções de aeronaves e componentes às quais não possui homologação e/ou autorização pela ANAC para própria realização, a AMAZONAVES contrata oficinas devidamente homologadas, fazendo entretanto acompanhamento de todo serviço de terceiros através de seu Engenheiro e/ou Inspetor de Manutenção.